در سال 2045، در میان یک فاجعه اقتصادی و تکامل سریع هوش مصنوعی در دنیایی که جنگ‌های پایدار در حال افزایش است، بخش امنیت عمومی 9، به رهبری موتوکو کوساناجی، به توکیو می‌رسد تا با "پست‌انسان" تاکاشی شیامامورا مقابله کند و تهدید قریب‌الوقوع جنگ هسته‌ای را متوقف کند. این یک فیلم تجمیعی با صحنه‌های جدید اضافه شده است.